Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC3P51654 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC3P51654 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC3P51654 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC3P51654 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC3P51654 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC3P51654 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC3P51654 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC3P51654 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC3P51654 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC3P51654 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC3P51654 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC3P51654 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC3P51654 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC3P51654 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms