Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA4P51532 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms