Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX5P50542 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX5P50542 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX5P50542 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX5P50542 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX5P50542 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX5P50542 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX5P50542 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms