Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARCN1P48444 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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