Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms