Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA2P42262 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA2P42262 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIA2P42262 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms