Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBP1P32455 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBP1P32455 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GBP1P32455 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GBP1P32455 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GBP1P32455 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GBP1P32455 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GBP1P32455 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GBP1P32455 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GBP1P32455 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBP1P32455 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBP1P32455 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBP1P32455 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBP1P32455 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBP1P32455 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBP1P32455 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBP1P32455 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBP1P32455 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBP1P32455 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBP1P32455 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBP1P32455 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms