Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA3P32297 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA3P32297 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA3P32297 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA3P32297 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA3P32297 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA3P32297 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA3P32297 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA3P32297 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA3P32297 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA3P32297 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA3P32297 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA3P32297 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA3P32297 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA3P32297 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA3P32297 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA3P32297 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA3P32297 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA3P32297 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA3P32297 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA3P32297 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA3P32297 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA3P32297 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA3P32297 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA3P32297 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA3P32297 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA3P32297 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA3P32297 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA3P32297 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA3P32297 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms