Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA13P31271 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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