Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMO2P25791 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMO2P25791 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMO2P25791 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms