Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms