Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GLI3P10071 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GLI3P10071 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GLI3P10071 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GLI3P10071 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GLI3P10071 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GLI3P10071 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GLI3P10071 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GLI3P10071 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GLI3P10071 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GLI3P10071 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GLI3P10071 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GLI3P10071 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GLI3P10071 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GLI3P10071 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI3P10071 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI3P10071 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI3P10071 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI3P10071 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI3P10071 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI3P10071 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI3P10071 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI3P10071 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI3P10071 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI3P10071 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI3P10071 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI3P10071 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI3P10071 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI3P10071 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI3P10071 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI3P10071 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI3P10071 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI3P10071 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI3P10071 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI3P10071 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI3P10071 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI3P10071 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GLI3P10071 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GLI3P10071 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GLI3P10071 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms