Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC192P0DO97 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms