Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOEP02649 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOEP02649 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOEP02649 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOEP02649 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOEP02649 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOEP02649 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOEP02649 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOEP02649 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOEP02649 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOEP02649 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOEP02649 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOEP02649 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOEP02649 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOEP02649 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOEP02649 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOEP02649 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOEP02649 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOEP02649 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOEP02649 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOEP02649 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOEP02649 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms