Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms