Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms