Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4M8

LINC00588, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00588, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00588Q9Y4M8 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00588Q9Y4M8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms