Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HPS5Q9UPZ3 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPS5Q9UPZ3 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms