Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1RE1Q9UN81 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
L1RE1Q9UN81 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms