Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
DKK2Q9UBU2 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms