Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLKQ9UBT6 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms