Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PNPLA8Q9NP80 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PNPLA8Q9NP80 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PNPLA8Q9NP80 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PNPLA8Q9NP80 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PNPLA8Q9NP80 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PNPLA8Q9NP80 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms