Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GCNAQ96QF7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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