Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SGF29Q96ES7 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SGF29Q96ES7 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SGF29Q96ES7 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SGF29Q96ES7 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SGF29Q96ES7 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SGF29Q96ES7 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SGF29Q96ES7 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SGF29Q96ES7 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGF29Q96ES7 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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