Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOPBP1Q92547 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms