Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC84Q86UT8 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms