Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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COL24A1Q17RW2 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
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COL24A1Q17RW2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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COL24A1Q17RW2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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COL24A1Q17RW2 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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COL24A1Q17RW2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL24A1Q17RW2 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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