Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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