Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DDR2Q16832 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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