Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP2B3Q16720 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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