Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FXNQ16595 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FXNQ16595 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FXNQ16595 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FXNQ16595 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FXNQ16595 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FXNQ16595 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FXNQ16595 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FXNQ16595 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FXNQ16595 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FXNQ16595 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FXNQ16595 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FXNQ16595 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms