Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
GABRA6Q16445 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms