Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ZFHX3Q15911 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AL807742.1-201ENST00000636678 1160 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZFHX3Q15911 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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