Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GAPVD1Q14C86 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
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