Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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SPIDRQ14159 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SPIDRQ14159 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SPIDRQ14159 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SPIDRQ14159 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SPIDRQ14159 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SPIDRQ14159 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SPIDRQ14159 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SPIDRQ14159 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SPIDRQ14159 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPIDRQ14159 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SPIDRQ14159 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SPIDRQ14159 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIDRQ14159 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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