Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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FOXE3Q13461 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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FOXE3Q13461 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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FOXE3Q13461 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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FOXE3Q13461 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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