Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE3BQ13370 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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