Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUSP4Q13115 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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