Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms