Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RAB40BQ12829 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RAB40BQ12829 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RAB40BQ12829 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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RAB40BQ12829 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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RAB40BQ12829 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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RAB40BQ12829 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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RAB40BQ12829 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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RAB40BQ12829 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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