Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FOXO1Q12778 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXO1Q12778 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms