Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms