Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms