Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GBE1Q04446 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GBE1Q04446 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GBE1Q04446 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GBE1Q04446 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GBE1Q04446 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GBE1Q04446 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GBE1Q04446 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GBE1Q04446 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GBE1Q04446 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GBE1Q04446 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GBE1Q04446 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GBE1Q04446 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GBE1Q04446 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GBE1Q04446 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GBE1Q04446 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
GBE1Q04446 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GBE1Q04446 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GBE1Q04446 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GBE1Q04446 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GBE1Q04446 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
GBE1Q04446 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GBE1Q04446 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GBE1Q04446 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GBE1Q04446 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GBE1Q04446 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GBE1Q04446 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GBE1Q04446 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GBE1Q04446 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GBE1Q04446 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GBE1Q04446 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GBE1Q04446 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GBE1Q04446 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GBE1Q04446 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GBE1Q04446 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GBE1Q04446 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GBE1Q04446 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GBE1Q04446 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GBE1Q04446 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GBE1Q04446 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBE1Q04446 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBE1Q04446 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBE1Q04446 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBE1Q04446 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBE1Q04446 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBE1Q04446 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBE1Q04446 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBE1Q04446 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBE1Q04446 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBE1Q04446 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GBE1Q04446 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms