Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 PPP2R3C-213ENST00000555644 1347 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 CNOT9-202ENST00000295701 1126 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC008268.1-201ENST00000425887 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 ANAPC10-209ENST00000507656 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC083967.1-201ENST00000522354 515 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AL137798.1-201ENST00000607700 339 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 OR6F1-203ENST00000641444 1698 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 LRRC72-202ENST00000401542 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms