Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NHLH2Q02577 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms