Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OTUD4Q01804 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms