Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
JAG1P78504 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
JAG1P78504 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JAG1P78504 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JAG1P78504 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JAG1P78504 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
JAG1P78504 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JAG1P78504 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
JAG1P78504 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JAG1P78504 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
JAG1P78504 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
JAG1P78504 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JAG1P78504 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
JAG1P78504 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
JAG1P78504 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
JAG1P78504 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
JAG1P78504 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JAG1P78504 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms