Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP46P62068 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP46P62068 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms