Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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ERVPABLB-1P60509 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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ERVPABLB-1P60509 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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ERVPABLB-1P60509 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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ERVPABLB-1P60509 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ERVPABLB-1P60509 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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